根据生物医学工程系的办学定位和实际状况，为保障本专业培养目标与社会发展及行业发展的需求相适应，本专业在2019届入学新生中开设了三个培养方向，分别为：医疗设备管理维护方向、康复器械工程方向及医学物理方向，具体流程与要求如下：

1)第一、二学年：所有学生按照本专业2018版本人才培养方案学习本专业的通识性课程及部分专业基础课，按照入学时的自然分班情况进行授课；

2)大二学年第二学期末：启动分专业方向的工作。由辅导员召开班会，各专业方向负责人通过班会介绍本专业的三个方向，具体包括各专业方向的培养目标、招收人数、筛选标准、课程体系、实习基地建设及就业方向等；

3)通过对各专业方向的了解，大二学生可根据自身的兴趣自主选择专业方向，并将初选结果报辅导员；

4)辅导员老师将学生初选结果上报系部，系部召开相关会议讨论初选结果，对其进行整体把控；

5)经过系部讨论及学生双向选择后，最终确定各专业方向的学生名单；辅导员向学生公示各专业方向的学生名单；在公示期内，学生如有疑虑，可向辅导员反馈；

6)公示期后，辅导员将公示结果上报系部，并通知到每位学生。

7)大三至大四学年，学生按照各专业方向的培养目标完成本方向的课程。